嘉靖二十一年(1542年1月16日─1543年2月3日)本年，羅伯茲•維拉洛博斯(Rui Lopes de Vilalobos)率西班牙船隊從墨西哥抵達菲律賓，為紀念後來的菲利浦二世(Filipe Ⅱ)國王，正式將該島改名為菲律賓。

嘉靖二十五年(1546年2月1日─1547年1月21日)本年，許四(梓)往日本貿易不利，回國後，離開雙嶼與海盜沈門、林剪、許獠劫掠閩浙海隅。許二(棟)則因兄弟許一(松)、許三(楠)喪亡，許四去日本，自己亦離開雙嶼，隨海盜朱獠、李光頭等協同番夷劫掠閩浙海隅民居。

嘉靖十九年(1540年2月8日─1541年1月26日)6月2日，平托乘坐的法里亞•索薩(António de Faria de Sousa)的船隊來到海南島的卡莫依海灣(Camoy Gulf)，這是一個為明宮廷採集珍珠的地方，他們冒充暹羅商人進港，當地人見他們是外國人，不懂當地的習俗與法律，立即勸他們離開。根據廣海都統的規定，這裡只允許採珠船進出，其餘船隻只要被發現，立即燒毀船隻，處死來人。

嘉靖二十一年(1542年1月16日─1543年2月3日)5月14日，法里亞•索薩船隊離開雙嶼，前往卡倫普盧伊島。

嘉靖二十三年(1544年1月24日─1545年1月12日)4月29日，第二批耶穌會傳教遠征隊從羅馬出發前往果阿，但被迫返回並改組。

嘉靖十九年(1540年2月8日─1541年1月26日)10月4日，教宗保祿三世發佈兩道簡諭，任命彿蘭西斯科•沙勿略及狄奧戈•羅德里格斯為教廷派遣東方各王及長老約翰的大使。

嘉靖十八年(1539年1月20日─1540年2月7日)6月5日，費爾南•平托隨同葡萄牙艦隊駛抵馬六甲。

嘉靖二十四年(1545年1月13日─1546年1月31日)6月，葡萄牙人佩羅•費達爾格(Pedro Fidalgo)駕駛一艘中國式帆船離開浡泥(Brunei，加里曼丹島北部汶萊)，由於逆風，他們駛向北部，在北緯9°或10°至22°處發現了一個人們稱之為“呂宋”的島嶼，島的走向是東北一南方，位於棉蘭老島(Mindanao)和中國之間。據說該島長250里格，樹木繁茂，它距中國很近，那裡的人用兩個金幣索換一個銀幣索。

嘉靖二十七年(1548年2月10日─1549年1月28日)3月17日，由10位耶穌會員組成的第5批傳教遠征隊分乘兩艘大黑船從里斯本出發前往遠東，其中一位就是《日本歷史》作者路易斯•彿羅依斯(Luis Fróis)。 施白蒂：《澳門編年史：16—18世紀》，第10頁。