萬曆三十三年（1605年2月18日─1606年2月6日）5—6月，欽差總督廣東珠池市舶稅務兼管鹽法太監李鳳與信官王權、梁宗翰等人主持，由澳門四街華商出資重建媽閣廟“神山第一亭”完成。澳門“四街”即“十字街”，這是一條縱街與一條橫街交叉而成的十字街，被明廷分別命名為“畏字街”、“威字街”、“懷字街”、“德字街”。這十字街本是諸夷建造居住。後多為華商租賃，葡人居樓上，唐人居樓下。

清道光九年（1829年2月4日─1830年1月24日）本年，媽閣廟重修完工。此次重修，由媽閣廟執事趙允菁、謝懷德、林欽懷等30人發起，得到廣東水師提督李增楷、香山協鎮將徐世雄、澳門同知鹿亢宗、香山知縣劉開域及粵海關澳門總口、各稅口省城謝東裕行、伍治光堂、潘同孚行等官商支持。合共收到捐銀7000餘兩。其中，澳門士商捐銀3674兩8錢3分5厘。重修工程始於道光九年（1829）仲夏，至季冬已告完工，道光十年（1830）又增修客堂僧舍。“至是，隘者拓之，崎嶇者曲折平之，天光水影，瑞石交輝，棟壁堅牢，美輪美奐。規模式煥，旁為之翼蓋。至是而朝暉夕陰，氣象一新。”道光乙丑的《重修媽祖閣碑誌》，轉自譚世寶：《金石銘刻的澳門史——明清澳門廟宇碑刻鐘銘集錄研究》，第50—59頁。