嘉靖十八年(1539年1月20日─1540年2月7日)6月5日，費爾南•平托隨同葡萄牙艦隊駛抵馬六甲。

嘉靖二十二年(1543年2月4日─1544年1月23日)9月23日，王直引葡萄牙人費爾南•平托、克里斯托翁•博拉略(Cristóvão Boralho)及迪奧戈•澤依莫托(Francisco Diogo Zeimoto)等航行赴日貿易，途遭到颶風，漂流到種子島。島上守官古市長門守(ふる いさなかとのがみ)對迪奧戈等3人十分熱情與尊敬，迪奧戈則以所帶火槍相贈。古市長門守給葡人1000兩白銀並請他們教他如何製造火藥。火槍遂傳入日本。五個半月後，島上仿製火槍已有600餘支。

嘉靖二十一年(1542年1月16日─1543年2月3日)本年，羅伯茲•維拉洛博斯(Rui Lopes de Vilalobos)率西班牙船隊從墨西哥抵達菲律賓，為紀念後來的菲利浦二世(Filipe Ⅱ)國王，正式將該島改名為菲律賓。

嘉靖三十二年(1553年1月14日─1554年2月1日)海盜葉宗滿勾引倭夷來市浙海，見浙江水師戒備森嚴，遂往廣東，市於南澳。

嘉靖三十九年(1560年1月27日─1561年1月15日)1月22日，王直伏誅。先是，閩浙總督胡宗憲將王直母、妻及子為人質，遣人赴日本招王直降。王直在胡宗憲重金勸誘及人質脅迫下，率其黨至定海納款。胡宗憲疏報朝廷，嘉靖帝詔令斬之於市。王直，原名鋥，號五峰，徽州歙縣人。

嘉靖二十五年(1546年2月1日─1547年1月21日)本年，許四(梓)往日本貿易不利，回國後，離開雙嶼與海盜沈門、林剪、許獠劫掠閩浙海隅。許二(棟)則因兄弟許一(松)、許三(楠)喪亡，許四去日本，自己亦離開雙嶼，隨海盜朱獠、李光頭等協同番夷劫掠閩浙海隅民居。

嘉靖二十一年(1542年1月16日─1543年2月3日)5月14日，法里亞•索薩船隊離開雙嶼，前往卡倫普盧伊島。

嘉靖二十三年(1544年1月24日─1545年1月12日)4月29日，第二批耶穌會傳教遠征隊從羅馬出發前往果阿，但被迫返回並改組。